因为城市开发而迅速发展的御代街（みしろまち）。
这里传说是一个被土地神和精灵守护的城市，但现在相信的人几乎已经不存在了。
尽管如此10年一次的土地神祭的城市游行仍是这里的一大活动。
在御鷹ヶ丘学園（みたかがおかがくえん）上学的主人公・瀬川彰人因为继承着古代的血脉而担任祭祀的神官。
并且青梅竹马捺菜被选上以保护土地神名义而挑选出来的巫女，彰人预感到这是一个特别的节日。
突然在准备祭祀的城市上发生了像小孩子的恶作剧般的不可思议的事件。
不久那个不可思议的传言开始流传。
「看见了奇怪的生物」
当然完全不相信传言的彰人在某天看见了奇怪生物的身影。
「果然看见了」
捺菜解释这是因为城市开发而失去住所而闯进来的精灵。
捺菜带着迷惑的彰人和精灵来到森林的深处，普通人踏入结界将出不来的禁地。
在那里彰人遇见了很久以前就住在这里的美丽土地神・涼。
和她接触后，彰人决心保护城市内出现的精灵们，带它们回到森林。
超越了人与神存在的时代的“羁绊物语”始动。
