故事起源于十日并出之难，一时间九州之内民不聊生，诸侯作乱。有着“神之子”称号的伊祁向天请求，得到箭神大羿相助。大羿射九日，除六凶，伊祁因其协助终平灾乱，被奉为九州共主。然而在和平仅维持数十年后，天象突变，一个“星灭”的不祥之象，伴随一场被称为“净”的灾难，再次席卷九州各国。
“净”所到之处即会发生洪水滔天、地裂山崩等灾难，千里之内的生灵于瞬间尽化乌有。九州诸国束手无策，越来越多的民众开始怀疑“净”是居于遥远天界的神灵降下的灾祸。九州共主伊祁帝决定于龙庭举行一场空前盛大的祈禳祭礼“星见大祭”，以求上苍化解“净”难。未料祭礼失败，夜空之中北斗、南斗两位星神消失于天际，众星纷乱。主持祭礼的神巫未央因此获罪，而关于伊祁帝神力尽失与失德的流言四起，更有甚者，认为唯有尽绝一切神祇，方能从绝望无边的灾难中解脱，而本就不愿屈服于伊祁帝的一些诸侯部族也开始于暗中蠢蠢欲动。
